金鸡纳碱呈白色颗粒或微晶性粉末状，无臭，略带有苦味，微溶于水、甘油，易溶于乙醇、氯仿，在硫酸中呈强蓝色荧光。金鸡纳碱作为生物碱主要存在于金鸡纳树和其同属植物的树皮中。其分子式为C20H24N2O2，相对分子质量为324，熔点为173～177℃。
金鸡纳碱与众多的酸易生成盐，其中几种盐类可用于医疗行业，被用于防止各种疟疾、解热，但治愈后容易发生复发，且具有不少的副作用，如头昏、耳鸣、恶心、呕吐等金鸡纳反应。
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