奎宁是喹啉类衍生物中的一种，能够与疟原虫的DNA进行结合并形成复合物，以抑制DNA的复制和RNA的转录，从而可以抑制疟原虫中蛋白的合成。
奎宁不仅能抑制蛋白合成，还能降低疟原虫的耗氧量，从而抑制疟原虫体内的磷酸化酶而干扰其糖代谢。此外，奎宁还可引起疟色素的凝集，但发展程度较为缓慢，不易形成大团块，且长伴随细胞死亡。
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